Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EMX1Q04741 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX1Q04741 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms