Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIM1P81133 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms