Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVK-24P63145 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-24P63145 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms