Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms