Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2MP61081 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms