Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AP3S2P59780 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms