Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NME5P56597 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME5P56597 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME5P56597 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NME5P56597 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NME5P56597 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NME5P56597 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms