Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAG2P55895 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAG2P55895 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAG2P55895 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAG2P55895 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAG2P55895 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAG2P55895 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAG2P55895 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAG2P55895 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms