Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP7P55210 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP7P55210 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP7P55210 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms