Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLK1P49759 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLK1P49759 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CLK1P49759 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms