Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms