Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKBRP32239 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms