Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCKARP32238 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms