Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA9P31269 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA9P31269 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms