Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNGA1P29973 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms