Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms