Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms