Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP4AP20648 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms