Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB4P16144 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms