Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MTHFD2P13995 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms