Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA4P13612 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA4P13612 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms