Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEFHP12036 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEFHP12036 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEFHP12036 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEFHP12036 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEFHP12036 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEFHP12036 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms