Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB1P11230 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms