Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RARBP10826 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RARBP10826 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RARBP10826 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms