Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRGAP2CP0DJJ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRGAP2CP0DJJ0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRGAP2CP0DJJ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms