Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms