Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSP90AB1P08238 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms