Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA1P02647 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA1P02647 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms