Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPBO95292 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPBO95292 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPBO95292 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms