Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN3O75935 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms