Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DYSFO75923 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DYSFO75923 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms