Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F6O75461 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F6O75461 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2F6O75461 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2F6O75461 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms