Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF5BO60841 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF5BO60841 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms