Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1FO60840 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1FO60840 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms