Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ABCC9O60706 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms