Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP9BO43861 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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