Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCAO15360 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCAO15360 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCAO15360 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCAO15360 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms