Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H7C1D1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H7C1D1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H7C1D1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H7C1D1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H7C1D1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms