Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF316A6NFI3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms