Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSDA5PKW4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms