Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms