Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP16Q9Y5T5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms