Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4L5

RNF115, E3 ubiquitin-protein ligase RNF115, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF115Q9Y4L5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF115Q9Y4L5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms