Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF330Q9Y3S2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms