Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms