Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1BQ9UPS6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms