Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS3Q9UNS2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms