Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSR3Q9UNL2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms