Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHIC2Q9UKJ5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms