Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms